1. DSpace en ESPOL
2. Unidades Académicas
3. Facultad de Ingeniería en Electricidad y Computación
4. Tesis de Computación

Title:	Validación y edición de resultados de detección de especies biológicas in-vitro
Authors:	Ochoa Donoso, Daniel, , Director Ordoñez López, Franklin José Murillo Ronquillo, Marck Anthony
Keywords:	Conteo de colonias bacterias Visor Automatización Raspberry
Issue Date:	2023
Publisher:	ESPOL
Citation:	Ordoñez López, F. J. y Murillo Ronquillo, M. A. (2023). Validación y edición de resultados de detección de especies biológicas in-vitro. [Proyecto integrador]. ESPOL. FIEC .
Description:	El conteo de colonias bacterias en platos Petri es una actividad monótona para los laboratorios que puede tomar unos segundos hasta minutos. Las alternativas del mercado pueden ser muy costosas, tener poca utilidad o resultados imprecisos. Por lo que el objetivo del proyecto es automatizar el conteo de colonias con desarrollo de un dispositivo que fotografíe los platos, procesar las fotos, contar las colonias y finalmente visualizar las capturas en una aplicación web. Este proyecto es una continuación [2] y consistió en implementar un raspberry con una pantalla táctil debidamente montados en una base que sostiene una webcam, una zona de iluminación para los platos Petri y además se desarrolló una aplicación web para visualizar y modificar de los resultados del servidor desarrollado en trabajos anteriores, también se realizaron cambios a dicho servidor. Los resultados del proyecto fueron la culminación del prototipo para capturar los platos, se mejoró el tiempo del proceso de calibración y segmentación obteniendo un promedio de 1.95 y 1.15 segundos respectivamente, se realizaron pruebas de usuario del capturador fotográfico donde se obtuvo el conjunto de datos que permitirá mejorar al algoritmo de detección de colonias y se documentaron algunas limitaciones para una posible continuación. En conclusión, se presenta un prototipo de alta fidelidad que fotografía platos Petri y usa el servidor anteriormente desarrollado en [2], se completan cambios que mejoran la solución desarrollada anteriormente, se entrega un visualizador y editor web para las fotografías y finalmente se proporciona un conjunto de datos de un entorno real.
metadata.dc.description.abstractenglish:	Bacteria colony counting in Petri dishes is a monotonous task for labs, this can take anywhere from a few seconds to several minutes. Market alternatives can be too expensive, have low utility or provide unreliable results. That is why the objective of this project is to automatize colony counting with the development of a device that takes photos of the dishes, process the images taken, count the colonies found and finally visualize them in a web application. This project is a continuation [2] and consists of the implementation of a Raspberry Pi with a touch screen mounted on top of a base that holds a webcam, a lighting zone for the Petri dishes and the development of a web application to visualize and modify the results of the process server that it was originally created in the previous project, we also made changes to it. The results of this project were the culmination of the prototype to capture the dishes, improvements to the process times for the calibration and segmentation tasks with a mean time of 1.95 and 1.15 respectively, we did user tests of the device where we obtained a dataset that will allow us to improve the detection algorithm of colony detection and we documented some limitations for a possible continuation. In conclusion, we delivered a prototype of high fidelity that captures Petri dishes and uses the server previously mentioned [2], we completed changes that improve the previous solution, we deliver a web viewer and editor for the photos taken and finally we provided a dataset captured in a real environment.
URI:	http://www.dspace.espol.edu.ec/handle/123456789/58461
metadata.dc.identifier.codigoproyectointegrador:	TECH-321
Appears in Collections:	Tesis de Computación

Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.