El presente trabajo tiene como fin proponer las mejoras en la operación y diseño del tratamiento secundario de una planta de tratamiento de aguas residuales de una industria de alimentos ubicada en la ciudad de guayaquil, con el propósito de que sus descargas al cuerpo receptor cumplan con los límites máximos permisibles que se encuentran establecidos en la normativa ambiental ecuatoriana, para lo cual se realiza un análisis del caudal actual de ingreso al sistema, así también de sus parámetros físicos – químicos y microbiológicos existentes en el tratamiento secundario, y por medio de los resultados obtenidos de la evaluación del sistema se establecen las bases de diseño y de operación óptimas para que la ptar logre la mejor remoción de las cargas contaminantes de las aguas residuales industriales.