Abstract:
CONDITION FOR PUBLICATION OF PROJECT. The rhizospheric microbiome of banana plays key roles in promoting plant growth and
suppressing soil-borne diseases. This study proposes to analyze the functional and taxonomic
diversity of the microbiome in rhizospheric soils from ten banana farms located in the province of
El Oro, Ecuador, considering two phenological stages of the plant. The approach is based on
shotgun metagenomics, complemented with functional annotations (eggNOG), redundancy
analysis (RDA), and the construction of functional and correlation networks in relation to the
plant's health status. In addition to generating metagenomic data associated with the banana
rhizosphere microbiome, the study aims to identify plant growth-promoting genes (PGPG), such
as glnA, phoD, acdS, and ipdC, distributed across multiple taxa. It is also expected to identify
specific microbial taxa whose presence or abundance correlates with the incidence of Dickeya
dadantii and Pectobacterium carotovorum, which could suggest a protective role of the
microbiome. These organisms could represent candidates for future biocontrol or biofertilization
strategies.
Keywords: rhizosphere, metagenomics, KEGG, PGPG, suppressiveness.
Description:
CONDICIONAMIENTO DE PUBLICACION DE PROYECTO. El microbioma rizosférico del banano cumple funciones clave en la promoción del crecimiento
vegetal y la supresión de enfermedades del suelo. Se plantea un estudio con el objetivo de analizar
la diversidad funcional y taxonómica del microbioma en suelos rizosféricos de diez fincas
bananeras en la provincia de El Oro, Ecuador, considerando dos estados fenológicos de la planta.
La propuesta tiene un enfoque metagenómico shotgun, complementado con anotaciones
funcionales (eggNOG), análisis de redundancia (RDA) y redes funcionales y de correlación con
el estado sanitario de la planta. Además del levantamiento de datos metagenómicos asociados al
microbioma de la rizósfera del banano, se espera la identificación de genes promotores del
crecimiento vegetal (PGPG), como glnA, phoD, acdS e ipdC, distribuidos en múltiples taxones.
Se espera también identificar taxones microbianos específicos cuya presencia o abundancia
correlacione con incidencia de Dickeya dadantii y Pectobacterium carotovorum, lo que podría
sugerir un rol protector del microbioma. Estos organismos podrían constituir candidatos para
estrategias futuras de biocontrol o biofertilización.
